Lagunas, ríos, pastizales, bosques de ribera, acebuchales, alcornocales, densos matorrales y numerosos cantiles rocosos conforman un conjunto único de ecosistemas que, junto a su ubicación estratégica en el Estrecho de Gibraltar, canalizan los flujos migratorios de cientos de miles de aves, convirtiendo a la Janda en un territorio de alta biodiversidad y gran relevancia para la fauna en el contexto europeo.